在督察工作動員會上，各督察組組長強調，督察要重點盯住中央高度關注、群眾反映強烈、社會影響惡劣的突出環境問題及其處理情況；重點檢查環境質量呈現惡化趨勢的區域流域及整治情況；重點督辦人民群眾反映的身邊環境問題的立行立改情況；重點督察地方黨委和政府及其有關部門環保不作為、亂作為情況；重點推動地方落實環境保護黨政同責、一崗雙責、嚴肅問責等工作情況。
據統計，截至8月14日，先期進駐的四川、青海、海南、山東、吉林、浙江、新疆（含兵團）等省（區）已受理群眾環境信訪舉報3090件，經梳理并合并重復舉報后交辦地方2361件，各地已辦結146件；累計責令整改367家，立案處罰81家，罰款220.92萬元；立案偵查2家，拘留6人；對黨政領導干部約談62人，問責62人。
根據安排，環境保護督察進駐時間約1個月左右。督察進駐期間，各督察組分別設立并向社會公布了專門值班電話和郵政信箱，受理被督察省（區）環境保護方面的來信來電。受理舉報電話時間為每天8點至20點（其中西藏為每天9點至21點，新疆及生產建設兵團為每天10點至22點）。
